“广宿主质粒”是指至少能够在变形菌门（Proteobacteria）的两个亚群（例如β-, γ-）之间互相转移并稳定传代的一类质粒，是重要的可移动遗传元件（mobile genetic elements）之一，在细菌基因组进化和适应特定环境选择压力过程中发挥着非常重要的作用。然而目前被分离并进行全测序的广宿主质粒尚不足60个，广宿主质粒的数据库信息仍十分缺乏，限制了对广宿主质粒生物学特性及其生态功能的进一步深入研究。因此，从环境样品中分离新的广宿主质粒并进行全基因组序列分析，仍是目前研究广宿主质粒最为重要的基本工作。
土壤化学组研究团队从环境样品中分离广宿主质粒并进行全基因组测序和遗传进化分析工作。其中取得的重要进展包括，采用三亲配对法，从沈抚污水灌区底泥中分离了1个广宿主质粒，命名为pSFA231。采用Illumina Hiseq 2000高通量测序平台对该质粒进行了全基因组序列分析，结果表明质粒pSFA231大小为41.5kb，包含50个开放阅读框架（open reading frames，orfs），是PromA 质粒家族的第6个成员，也是从中国发现的第一个PromA 质粒。根据复制起始蛋白RepA的氨基酸残基序列以及整个骨架基因结构DNA序列的进化分析结果，可将PromA 质粒家族划分为2个亚类： PromA-α （pMRAD02, pSB102） 和 PromA-β（pMOL98, pIPO2T, pSFA231, pTer331）。研究结果在 Frontiers in Microbiology发表。
Li XB, Top EM, Wang YF, Brown C, Yao F, Yang S, Jiang Y，Li H*. 2015. The broad-host-range plasmid pSFA231 isolated from petroleum-contaminated sediment represents a new member of the PromA family. Frontiers in Microbiology, 5:777. Doi: 10.3389/fmicb.2014.00777 (IF: 3.989)
